大阪大學醫學研究生院和滋賀大學數據科學學院的聯合研究小組開發了一種新的數學分析方法,該方法整合了基因表達水平和 DNA 甲基化修飾數據,使其成為食管癌細胞的抗癌藥物。我們已經確定了一種影響 DNA 功效的新基因。
最近的癌症研究表明,異常的基因表達和 DNA 甲基化修飾會影響癌症的形成和進展。例如,在胃癌細胞中,已知一種名為 NKX6-1 的基因在感染幽門螺桿菌後會引起異常甲基化,從而導致癌症復發。由此可知,異常的基因表達和甲基化修飾會影響癌症的惡性程度,但所有基因(約22000個基因)的表達水平和甲基化修飾水平都是數據量,由於體積龐大,難以進行綜合分析,因此遠的。
這一次,研究組開發了一種新的數學分析方法,可以對基因表達水平和DNA甲基化數據進行綜合分析。以每年導致1人死亡的“食道癌”為研究對象,通過數學分析方法對人食道癌細胞數據進行檢測,發現食道癌特異性基因表達量增加,甲基化修飾量減少。新基因TRAF4。此外,明確了該基因是調節食道癌作為抗癌藥的功效的基因。
未來,預計將對其他癌症進行相同的分析,以確定影響抗癌藥物在各種癌症中的功效的基因。