成百上千種細菌生活在人體腸道中,形成腸道菌群。雖然噬菌體被認為對腸道菌群的形成和活性有很強的影響,但關於它們的多樣性和生態系統還有很多未知數,它們在人體腸道中也被稱為“暗物質”。

 這一次,來自早稻田大學、東京醫科大學和國家全球健康與醫學中心 (NCGM) 的研究人員收集了日本 4D(疾病藥物飲食日常生活)微生物組項目中註冊的 4,198 名日本人的大規模鳥槍宏基因組數據。通過分析,我們試圖闡明生活在人類腸道中的噬菌體的全貌。

 通過構建原始信息分析管道並將其應用於宏基因組數據,我們成功識別了1,000多種噬菌體的基因組信息。有趣的是,還發現了許多以前未知的新型噬菌體群,儘管它們在人體腸道中含量豐富。

 此外,為了闡明影響腸道噬菌體群落的因素,我們進行了綜合關聯分析,發現年齡、性別、飲食習慣、生活方式、疾病和藥物攝入等多種因素都與腸道相關。噬菌體群落。發現與噬菌體群落有關這些因素中的大部分也與影響腸道菌群的因素一致,強烈暗示細菌和噬菌體群落在人體腸道中存在密切關係的可能性。我可以說。

 本研究闡明了人類腸道中噬菌體群落的總體情況,包括新的噬菌體群。預計控制及其應用將導致開發新的疾病治療方法。

論文信息:[Nature Communications] 人群水平隊列中廣泛的腸道病毒組變異及其與宿主和環境因素的關聯

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