7月20日,東海大學醫學院基礎醫學系Nori Imanishi教授領導的研究小組宣布,他們成功開發出快速基因組分析系統,可應用於細菌感染的診斷。它可以用便攜式測序儀和兩台筆記本電腦進行分析,兩小時內就可以鑑定出基因組序列數據庫中登記的2多個細菌物種和菌株,因此有望在災難現場和熱帶地區發揮作用。

 肺炎和食物中毒等細菌感染是世界範圍內的主要問題。致病菌種類較多,細菌感染可通過細菌培養方法診斷。但需要1-2天才能做出判斷,而且由於難培養細菌的存在以及培養條件的不相容,菌株鑑定困難。因此,在很多情況下,都是根據經驗給患者服用抗菌藥物。人們認為這會延遲有效的藥物施用並促進耐藥細菌的出現。

 這次,研究小組創建了一個基因組分析系統,由便攜式 DNA 測序儀 MinION 和兩台筆記本電腦組成。它被用來檢查多個最近混合的 DNA,驗證準確性和時間。他們發現,在兩小時內,他們就能夠讀取 DNA 序列並識別出涉及的主要細菌。當我們使用同一系統實際分析膿胸患者的胸腔積液標本時,我們能夠快速檢測到被認為是病因的厭氧菌。然而,關於細菌的組成,由於需要大量的計算時間,發現還有進一步改進的空間。

該系統的進一步發展將有助於選擇合適的抗菌藥物並抑制耐藥細菌的出現。

論文信息:[科學報告] 使用基於納米孔的測序儀和筆記本電腦進行快速細菌成分分析的便攜式系統

東海大學

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