Kazusa DNA 研究所、島根大學和京都府立大學聯合解碼了代表櫻花的流行品種吉野櫻花的基因組。遺傳分析使預測開花時間成為可能。
吉野櫻花樹被認為是江戶彼岸和李屬的種間雜種。它通過扦插等進行克隆和繁殖,不僅在日本而且在世界各地都有種植。預測吉野櫻花樹的開花日期對於旅遊業來說非常重要,但很少有關於開花的分子生物學分析。 原因之一是基因組結構複雜,因為它有兩個基因組,不容易分析基因組和基因。
在 Kazusa DNA 研究所,我們分析了種植在上野 Onshi 公園的吉野櫻花樹的基因組,並分析了島根大學擁有的 139 個品種(SNP 分析),並創建了基因預測和連鎖圖譜。此外,島根大學和京都府立大學共同尋找與開花有關的基因。
其結果是,正如大家所普遍接受的那樣,吉野櫻找到了以江戶彼岸和大島櫻為祖先的可能性。它的基因組結構與其密切相關的物種櫻桃、桃子和海膽非常相似。據估計,吉野櫻花的兩個祖先物種在2萬年前被分離成不同的物種,並且人們認為吉野櫻花是在這兩個物種在一百零幾十年前通過重聚時誕生的。我們分析了開花前552年(每2個月)和開花前1個月(每1天)的芽的轉錄本,並闡明了直到吉野櫻花開花前基因表達的變化。
這將使吉野櫻桃祖先的準確識別、開花日期的準確預測和新品種的開發成為可能。研究結果將發表在 Kazusa DNA Research Institute 運營的 DBcherry 數據庫中。
論文信息:[BioRxiv] 種間雜交開花櫻桃 SomeiYoshino (Cerasus x yedoensis) 的分階段基因組序列