文部科學省國立大學法人評估委員會對 86 所國立大學和 2016 所國際大學制定的 2021-3 學年第三期中期計劃中 2017 學年的進展情況進行了評估大學、宮崎大學和琉球大學被認為“進展顯著”，而大阪大學和熊本大學則被認為落後於計劃。
根據文部科學省的評價，最高評價為“進步顯著”、“有一定的興趣點”、“進展順利”、“進展總體順利”、“落後”，分為分為6個階段的“重大改進項目”。
大阪大學和熊本大學排名倒數第二，“落後”。大阪大學入學考試的提問和評分出現錯誤，學校反應遲緩導致評價不佳。熊本大學實行年薪制的教職工人數沒有達到目標。沒有與“重大改進項目”的最差評價相對應的地方。
滋賀大學和宮崎大學在改善和簡化業務運營方面被評為最高評價的“顯著進步”，而琉球大學則在改善財務內容方面被評為最高評價。滋賀大學因建立日本第一個數據科學係並與 37 家公司簽署合作夥伴協議而受到讚揚。
宮崎大學接受當地企業的捐贈開設了區域設計課程，並因開發了企業、居民和學生可以共同學習的設施作為區域交流場所而受到認可。琉球大學因設立旨在支持單親母親家庭的基金等特色基金而受到高度評價。
