東京大學分子與細胞生物學研究所的 Masami Horikoshi 副教授領導的一個研究小組正在研究基因控制系統的複雜性，該系統被認為在古細菌進化成真核生物的過程中發揮了核心作用，發生在大約25億年前。闡明了這一機制
大約60年前，鮑林等人創建了“分子進化”領域，從DNA和蛋白質序列預測進化轉變，但現在已經沒有了，而且不可能直接知道分子水平上的進化機制。
因此，該小組著眼於DNA和蛋白質中含有的重複序列，並在世界上首次設計了一種新的分析方法，可以計算出現存基因與祖先基因在進化過程中發生的差異。利用這種分析方法，研究小組首次揭示了大約25億年前發生的從古細菌到真核生物的進化過程。指導轉錄起始的 TBP（TATA 盒結合蛋白）重複序列的突變在真核細胞中高度保守，許多轉錄相關因子與真核 TBP 相互作用。更複雜。
通過闡明古代發生的進化機制，有望澄清迄今為止尚未解答的分子進化的各種問題。
